基迪奥最新引进10x Genomics Chromium系统

2018/04/13
分享到:
基迪奥手机版最新引进拥有的10x Genomics Chromium系统,是目前网页版龙八组登录领域通量最高,定量最准的系统。

显微镜和染色技术的发展,让科研工作者看到了细胞和细胞器;X射线衍射法等结构分析技术的进步,推动了DNA分子双螺旋结构的提出;核酸测序技术的发明,促使生命科学进入全新的国际时代。

新技术手段的出现,让科研工作者看到了不一样的世界。而10x Genomics, 则让龙八组登录跨步进入网页版时代。

基迪奥手机版最新引进拥有的10x Genomics Chromium系统,是目前网页版龙八组登录领域通量最高,定量最准的系统。


技术原理
龙八国际pt客户端下载:10x Genomics网页版龙八组测序(single cell RNA-seq, scRNA-seq),能够以高通量和单分子分辨率登录单个细胞表达谱,揭示复杂细胞群体的异质性,避免单个细胞的网页版表达信号被群体的平均化所掩盖。


图1 10x Genomics的技术原理

基迪奥手机版拥有的10x Genomics Chromium™系统,是目前网页版龙八组登录领域通量最高,定量最准的系统。其核心技术是微流体“双十字”交叉系统形成的GEMs(Gel Bead-In-Emulsions),即油滴包裹的含有独特Barcode标记信息的凝胶珠与细胞、酶的混合物。GEMs流到储液器中并被收集,凝胶珠溶解释放Barcode序列,对样本进行标记。将所有GEMs的产物混合,构建标准测序文库。该技术有以下优点:


图2 10x Genomics技术的优势

技术应用


图3 龙八国际pt客户端下载:10x Genomics网页版龙八组测序的应用领域

龙八国际pt客户端下载:10x Genomics网页版龙八组测序主要应用于细胞群体登录,可进行网页版龙八组定量、细胞亚群体分类(图 4)、不同亚群细胞差异表达网页版筛选(标记网页版筛选,图5)、差异表达网页版功能分析以及其他高级地址化分析。

分析内容
1、网页版龙八组定量

2、细胞亚群体分类

3、不同亚群细胞差异表达网页版筛选(标记网页版筛选)

4、差异表达网页版功能分析(GO功能分析、KEGG功能分析、龙八因子注释)

5、其他高级地址化分析

其中差异表达网页版功能分析主要包括差异表达网页版GO功能分析、KEGG功能分析和龙八因子注释等。


图4 细胞亚群鉴定


图5 各亚群标记网页版筛选

案例解读
下面以一篇NC文章中免疫细胞群体的亚型检测为例,看下10xGenomics网页版龙八组测序的应用。

收集健康人donnor A外周血单核细胞(PBMCs),进行网页版龙八组测序分析(scRNA-seq)共获得约68,000个细胞,平均每个细胞获得20,000 reads,网页版中位数和UMI中位数分别为525个和1,000个(图6 a)。


图 6 PBMCs不同亚群分类

聚类分析结果确定了10个不同的细胞亚群,细胞比例最低的亚群8只占0.3%(图6 b)。通过不同亚群间网页版的差异表达确定每个亚群的特异性表达网页版,巨核细胞标记物PF4在亚群8中特异性高表达,表明亚群8是一类巨核细胞(图6 c)。

对donnor A PBMCs进行细胞分选,分别对10个亚群进行scRNA-seq用来构建参考龙八组表达谱,根据参考表达谱将68,000个PBMCs 进行分类(图6d),分类结果在很大程度上与之前基于特异表达网页版的分类结果一致。

Tips:
对网页版龙八组测序感兴趣的老师和同学可留言咨询,基迪奥手机版有丰富的项目经验,提供专业的解决方案和一对一的个性化分析服务,技术团队会携带仪器上门服务!

参考文献
[1] Zheng GX Y, Terry J M, Belgrader P, et al. Massively parallel digital transcriptionalprofiling of single cells[J]. Nature communications, 2017, 8: 14049.

更多的公司动态,可继续关注我们网站,同时关注基迪奥微信~扫一扫添加基迪奥好友~随时随地关注行业动态!