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中山大学生命科学学院项目

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(一)各样品测序所得reads的成分分析

如图所示。

A图表示10个样品的reads长度分布。

B图表示10个样品总reads的注释结果在长度上的分布。

C图:左图为10各样品的总reads的注释结果统计,右图为唯一比对的reads的注释结果统计。

(二)各样品miRNA组的表达量及功能分析

(三)差异表达的miRNA在样品间的分布统计

(四)miRNA Target Genes的KO分析

分析结果:图A是全部样品的miRNA靶网页版的KEGG显著性富集结果,图B为三个阶段里的KEGG显著性富集结果。从图中可以得到miRNA疑似手机版的网页版在骨骼肌生长的不同阶段中主要参与了那些功能。

(五)差异表达的miRNA趋势分析

分析结果:使用STEM软件对差异表达的miRNA进行了趋势分析:

A表示在骨骼肌纤维组装过程(35dpc~77dpc)共4个样品中差异表达的miRNA聚类,有3个趋势显著;

B表示在骨骼肌纤维成熟过程(77dpc~180dpn)共6个样品中差异表达的miRNA聚类,有2个趋势显著。

(六)候选肌原性miRNAs 表达模式聚类

分析结果:与肌纤维相关miRNAs有相同的表达模式的差异表达miRNAs被找出并聚类为6类。该图展示了各类共25个miRNA在10个样品中的均一化表达量。

(七)qPCR验证

分析结果:对10个样品大量表达的随机9个miRNA的表达量进行qPCR验证,图中只列出了2个miRNA作为说明。

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