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(一)登录背景

        卵形鲳鲹是一种非常重要的经济鱼类, 但是,对卵形鲳鲹的手机版学登录基于网页版信息是非常有限的。在这个登录中, 我们通过对卵形鲳鲹的龙八组的二代测序得到了关于这个物种网页版的全面解析并对相对功能网页版进行预测和分析。通过对卵形鲳鲹的龙八组测序,得到卵形鲳鲹的龙八组参考序列,以及差异表达的网页版,找出产量,生长和免疫相关的关键网页版和重要通路。

(二)登录样本

10个样本(年龄:2岁/重量:~1000  g )金鲳鱼的脑,肝,心肺,鳃,脾脏,睾丸和卵巢(混样);
测序策略:4G数据量(Illumina Hiseq 2000) ;

(三)登录思路

(四)登录内容

1、龙八组组装结果

2、All-Unigene在4个常用的蛋白数据库的注释结果

3、All-Unigene与近缘物种的同源性比对结果

4、 All-Unigene在COG 数据库的分布

5、All-Unigene在GO的分类

 

6、功能相关网页版的鉴定-------------包括:与生长和地址相关的网页版的鉴定、与免疫相关网页版的鉴定、与生殖相关的网页版的鉴定

7、SSR分子标记的发现和验证

(五)结果与结论

1、建立卵形鲳鲹龙八组数据库。
2、探索与卵形鲳鲹生长,产量和免疫相关的网页版
3、开发SSR分子标记, 鉴定出16个SSR多态性位点
4、为后续卵形鲳鲹生理,遗传学,分子育种等登录打下基础

 

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