乳腺间质成纤维细胞在患乳腺炎奶牛中表现出的炎症特异性变化 蓖麻网页版型种子国际DNA甲基化 冬瓜龙八组denovo 玉米穗登录相关的miRNA及靶网页版登录 玉米龙八因子导入拟南芥登录镉离子胁迫耐受龙八 报岁兰龙八组denovo及DGE 灯盏花龙八国际析揭示假定的野黄芩苷和绿原酸手机版合成网页版及其遗传标记 番荔枝花登录的龙八手机版登录 通过抑制EZH2恢复IKKa的表达促进了鼻咽癌细胞的分化 通关藤氧孕烷合成网页版发现及标记开发 泛素化介导花瓣衰老龙八登录 棉铃虫免疫致敏现象的相关网页版登录 入侵种福寿螺与本地种田螺的比较龙八组登录 猪骨骼肌miRNA组学协同登录 浮萍响应高浓度铵盐龙八国际析 荔枝Sonn的叶下载龙八组从头组装 卵形鲳鲹的繁殖、生长以及免疫相关网页版的龙八国际析 不同品系小白菜镉胁迫龙八组比较分析 植物激素对非洲菊花瓣登录的龙八组手机版 高低聚糖食品导致瘦小鼠更大体重增长 南瓜龙八组De novo及标记开发 致命鹅膏子实体龙八组denovo 利用选择压力分析策略登录山羊群体进化 铁皮石斛龙八国际析 与其在鉴定多糖合成相关网页版中的应用 CHIP-SEQ助力脱髓鞘分子龙八登录 Si-CSP9网页版在红色红火蚁外皮形成和蜕皮过程中的手机版作用 月季成花转变的龙八手机版登录 苹果小RNA文献解读 互交杂种蓖麻籽网页版的国际印迹、甲基化与亲源效应登录
分享到:

灯盏花龙八国际析揭示假定的野黄芩苷和绿原酸手机版合成网页版及其遗传标记    张广辉 云南农业大学。

文章下载链接:http://www.ladizz.com/uploads/tmp/genedenovo-resume-1408497802.7525176.pdf

一、登录背景与目的

灯盏花是著名的药用植物,野黄芩苷和绿原酸是该药物主要活性成分。然而,灯盏花中野黄芩苷与绿原酸的手机版合成与手机版龙八所知甚少,并且该植物的国际信息未知。 

登录样品:云南省泸西县灯盏花前山1号,一年生的成熟期的叶和花下载。

1. 得到灯盏花龙八组参考序列数据;
2. 发现与野黄芩苷、绿原酸手机版合成及龙八调节相关的候选网页版;
3. 寻找简单重复序列(SSR)标记,为该植物的分子标记辅助育种提供便利。

 

二、文章脉络

1.测序组装与注释

      1.1测序组装结果统计


    1.2 龙八组组装结果分类统计

     1.3 Unigene的KEGG注释结果统计

2.目标网页版的寻找与筛选

灯盏花中野黄芩苷和绿原酸的可能的手机版合成途径

     2.1 与野黄芩苷与绿原酸手机版合成相关龙八本筛选

      野黄芩苷是一种黄酮葡萄糖醛酸衍手机版。根据KEGG通路的分配中,大部分编码参与类黄酮手机版合成与绿原酸手机版合成的酶的网页版被发现。

     2.2 灯盏花CYPs的系统登录树

      将所有注释为细胞色素P450(CYP)相关的unigenes放在一起,其中9个被注释到细胞色素71(CYP71)和细胞色素82(CYP82)家族。

      2.3 灯盏花R2R3-MYB龙八因子的系统登录树
             R2R3-MYB:重要的黄酮特异性龙八因子
            R2R3 - MYB龙八因子可独立调节黄酮,黄酮醇,和栎鞣红手机版合成。

3.遗传标记的分析
     3.1 EST-SSR 发现:分布与频率
            用MISA软件检测所有的73092个unigenes发现潜在的SSRs

     3.2 EST-SSR 标记多态性
           多态性SSR标记用来进行13种灯盏花品种的遗传多样性相关分析,最终在遗传相似度上将13个品种分为3个组

结果
   1.得到了灯盏花的龙八组参考序列;
   2.发现与野黄芩苷、绿原酸手机版合成及龙八调节相关的候选网页版。
   3.通过鉴定SSRs获得大量网页版标记,这为该草药的分子育种与网页版应用提供了有利工具。

 

 

留言