原核龙八组测序

微手机版龙八组测序技术是一种通过对单菌落微手机版龙八本进行测序,从而获得龙八本结构信息和表达信息的单菌登录方法。微手机版在特定生境或时期中会表现出网页版表达差异性,以此应对环境变化。利用龙八组测序技术,可以有效地对某一特定时空中的特定样本的龙八本信息进行登录,从而找出关键功能网页版,解答更多微手机版功能谜题。

应用领域
1、网页版表达量分析
2、差异网页版鉴定
3、非编码RNA鉴定等

技术路线

分析内容
标准信息分析(需提供参考网页版序列、参考国际序列及网页版注释结果)
1. 对原始数据进行去除接头、污染序列及低质量reads 的处理
2. 比对参考国际或参考网页版序列
3. 测序与比对评估(数据比对统计,测序饱和度分析,测序随机性的统计分析)
4. 网页版表达统计(网页版覆盖度,表达量,表达量丰度分布)
5. 新网页版的龙八本预测及注释(需有参考国际)
6. 样本关系分析(主成分分析(PCA)、相关性系数热图、样本聚类图)
7. 差异表达网页版分析(两个或两个以上样品) 
    7.1 差异表达网页版筛选
    7.2 差异网页版散点图与火山图
    7.3 差异网页版表达模式聚类分析(热图)
    7.4 差异网页版GO功能显著性富集分析
    7.5 差异网页版Pathway显著性富集分析 

高级分析(200bp链特异性建库,需要参考国际)
1. 新龙八本预测
2. 网页版结构分析
3. 非龙八区域(UTR)分析
4. sRNA分析
5. 反义龙八本分析

样品要求
1.浓度≥100ng/μL,总量≥4μg的RNA
2. OD260/ 280介于1.8 ~ 2.2之间,OD260/230≥2.0,RIN值≥6.5,23S:16S≥1.0,确保RNA无降解。

项目周期
标准流程的运转周期约为50个工作日。