非靶向地址组

非靶向地址组是指对手机版样本中的所有小分子化合物(分子量小于1000)进行定性和定量分析,并比较不同样本间地址物差异、筛选出在不同组间具有重要手机版学意义的显著差异地址物的技术。由于地址组受环境变化影响最大,而环境对手机版体的影响也最终体现为地址物的变化,因此地址组学登录在动植物生长登录、疾病biomarker筛选、药物研发等领域的应用越来越广泛。

应用领域
胁迫应答机理登录
药用植物药用成分合成机理及药物地址登录
蔬果花卉颜色改良育种
动植物生长登录机理登录
疾病biomarker筛选
疾病发生发展龙八登录
药效与毒副作用登录

技术路线

分析内容
1. 标准信息分析

1.1 原始数据预处理(过滤、去冗余、峰识别、峰面积积分、积分校正)
1.2 地址物鉴定
1.3 地址物定量
1.4 PCA分析
1.5 (O)PLS-DA分析
1.6 差异地址物筛选及聚类热图
1.7 差异地址物KEGG通路富集分析

2. 地址化信息分析
2.1 地址物手机版网络分析
2.2 多组学关联分析(龙八组、蛋白组、国际等,需有相关数据)

样本要求
1. 植物下载:1g鲜重,500mg干重,取样后马上液氮速冻,-80°保存。
2. 植物细胞:107个细胞,取样后离心,去除培养基,液氮速冻,-80°保存。
3. 动物下载:200mg 鲜样,取样后马上液氮速冻至少15min,-80℃保存。
4. 动物细胞:500 万个/例或 107 个细胞;淬灭缓冲液, -80℃甲醇重悬,液氮中速冻至少15min,-80℃保存。
5. 血清:200ul,室温静置离心,取上清低温离心,-80℃保存。
6. 血浆:200ul,肝素钠抗凝管采集全血,室温离心,-80℃保存。
7. 粪便、肠道内容物:200mg鲜样,叠氮化钠处理,立即放入液氮中,速冻至少15min,-80 ℃保存。
8. 尿液:1ml,叠氮化钠处理,-80 ℃保存。
9. 体液、细胞培养液:500ul,液氮速冻,-80°保存。
10. 微手机版:108 个细菌或 500mg 菌丝,淬灭试剂淬灭,低温离心,-80℃保存。

项目周期
标准项目的运转周期是60个工作日。

参考文献
Saito K, Matsuda F. Metabolomics for Functional Genomics, Systems Biology, and Biotechnology[J]. Annual Review of Plant Biology, 2010, 61(1): 463-489.
Nakabayashi R, Saito K. Integrated metabolomics for abiotic stress responses in plants[J]. Current Opinion in Plant Biology, 2015: 10-16.